죽어도 되살아나는 바이러스
영화는 진양의 검역소와 통행료 징수소에 들어가는 사람들을 안내하기 위해 고안된 마네킹으로 시작된다. 요금소 너머에는 검역 요원이 검역 및 청소 차량을 설치합니다. 트럭을 운전하는 농부는 창문을 열고 구제역이라고 불만을 토로한다. 소독제는 구제역이 아니라 바이오복합식물체에서 물질이 유출됐다고 한다. 그 동포는 화를 내며 트럭을 운전하며 저번에 그랬는데 더 이상 믿을 수 없다고 말합니다. 그 순간, 누군가로부터 전화가 걸려오고, 판사는 한 번 쳐다보더니 큰사슴을 때린다. 무스에 치인 것을 확인한 트럭 운전사는 침을 뱉으며 운이 나쁘다며 다시 트럭을 몰고 떠났다. 하지만 죽은 줄 알았던 무스가 하얀 눈이 노출되고 관절이 부러진 채 깨어나는 장면이 있는데, 이후 석우(공유)는 일을 시작하고 퇴근 후 주차장에 있는 아내를 아파트로 불러들인다. 딸(Suan)의 양육권에 대해. 수안은 부산에 계신 어머니가 보고 싶다고 한다. 석우는 일 때문에 싫다고 거절하지만 수안은 거짓말을 했다고 하지만 둘은 함께 부산으로 간다.
바이러스 감염의 시작
서울역은 저마다 목적지가 정해져 있는 많은 사람들과 함께 KTX를 탔다. 야구팀 치어리더 진화(안소희)와 영원(최우식)도 기차에 오르고, 석우는 김대리에게 안산에 폭동이 일어나고 있다는 소식을 듣게 된다. 그리고 기차가 떠나기 직전, 가출한 소녀(심은경)는 가쁜 숨을 몰아쉬며 기차에 올라탄다. 그들을 보지 못한 역무원은 운전자에게 수신호를 보내고 운전자는 승강장을 닫고 차를 몰고 갑니다. 열차가 출발한 후 역무원이 역에 들어가는데 갑자기 두건을 쓴 감염된 사람이 튀어나와 역무원을 공격한다.
감염자와 훈련
석우는 지쳐서 잠이 들고 수안은 잡지를 읽다가 화장실에 간다. 수안은 승무원 용석(김의성)과 노숙자들을 원하고, 용석은 수안에게 공부 안 하면 저 노인처럼 될 거라고 말한다. 수안은 엄마가 나쁜 사람이고 엄마도 공부 안 열심히 했다고 말하는 사람이 웃으며 자리로 돌아간다. 다른 화장실에 간 수안은 우연히 상화(마동석)를 만난다. 다른 객실에는 승무원이 끼어들어 쓰러진 여성을 발견하고 발작과 경련을 일으키며 팀장에게 도움을 요청했다. 승무원이 외면하자 가출한 소녀는 벌떡 일어나 관절이 부러지고 좀비로 변해 승무원을 물어뜯는다. 열차 안은 난장판이 되고, 열차가 천안 아산역을 논스톱으로 통과할 것이라는 선장의 안내방송이 나온다. 이때 석우는 엄마에게 걸려온 전화를 받고 달려가지만 석우와 수안이 걱정돼 숨이 가쁘다 붙잡는다. 기차에서 살아남은 이들은 좀비와 싸운다.
기차의 종착역인 부산역
사투를 벌인 석우는 기관차에 올라 조종석으로 들어가지만 알고 보니 기관사가 아니라 전염병인 용석이었다. 석우와 용석은 싸우며 석우를 밀어낸다. 용석은 수안의 비명에 결국 수안과 함께 성경을 보게 되고, 석우는 이들과 싸우다가 용석에게 깔려 죽을 위기에 처한다. 코너링과 커브의 끝에서 용석을 트랙 위로 밀어내던 석우는 돌이킬 수 없는 상황임을 깨닫고 기관실로 들어와 주변을 둘러보다가 감속레버라고 생각하는 것을 보여주며 묻는다. 그를 당겨. 그리고 감염이 진행되면서 처음으로 갓 태어난 수안을 품에 안고 눈을 부릅뜨고 트랙에 몸을 던지던 때를 떠올리며 미소를 지었다. 살아남아 부산으로 온 성서와 수안의 얼굴을 볼 수 있다. 한편, 터널 반대편에서는 신원불명의 2명이 해당 방향으로 들어오는 것으로 보고돼 감염 여부를 확인하라는 지시를 받는다. 터널은 조명 부족으로 확인할 수 없고 육안으로 볼 수 없는 상태였기에 즉시 민원이 접수돼 살해 명령이 내려졌다. 찬애 수안은 방아쇠에 손가락을 대고 당길까 말까 망설이는 머리를 겨누고 터널에서 교내 집회 때 불렀던 노래를 부른다. 보초는 생존자들이 다가오고 있다고 외치며 수안과 성서를 구하기 위해 병사들이 진입하면서 영화는 끝난다.